东亚是世界淡水鱼类多样性最丰富的地区之一，形成了以鲤科（参考《中国动物志: 硬骨鱼纲. 鲤形目》的分类系统）鱼类为主体的独特的鱼类构成。其中，一类被称为“东亚鲤”的类群（约154种）最为特殊，它们占据了季风区大量的生态空间，表现出对河流-湖泊生态系统的高度适应。这些鱼类不仅成为东亚国家淡水养殖的重要对象，如青、草、鲢、鳙、鳊、鲌、鲴、赤眼鳟等，还在世界各地的淡水水域中造成了严重的生态入侵。以往基于分子系统学的观点认为，东亚鲤是东亚季风活动的产物。然而，这些研究关于东亚鲤的进化时间（如，推测的起源时间跨度从14.49到43.3百万年前不等）和进化关系并没有达成一致。因此，东亚鲤的起源和演化是否与东亚季风相关仍需要评估。如果两者有关系，在季风的影响下，东亚鲤是如何形成当前的分布模式的？支撑东亚鲤伴随季风演化的潜在因素是什么？为了理解这些问题，研究人员从生态地理、系统发育、宏观进化和比较基因组等角度对东亚鲤进行了系统地调查。

　　研究显示：

图3 东亚鲤的宏进化分析。（A）成种速率分析，紫色表示“河-湖”类群。（B）DTT分析显示东亚鲤在季风增强期有明显的形态快速分化。（C）支系间的分化（黑色）和扩散（红色）事件也都在东亚季风盛行期达到了最大。（D）东亚鲤的起源与扩散，箭头的粗细表示扩散事件的强度。（E）各区域之间的物种扩散，圆圈的面积表示支系分化事件发生的频次。 

　　3、为何东亚鲤在季风区表现出如此高的优势呢？基于比较基因组学的研究发现，东亚鲤群体中与大脑等神经系统功能相关的基因（包括环境感知和惊吓反应维持等）在调控区存在大量的变异。这些遗传变异是所有东亚鲤共享而其它鲤科鱼类中没有的，涵盖大量新出现的调控元件和保守元件的大片段特异突变。这意味着东亚鲤在脑等神经系统的调控层面发生了一些独特的改变。事实上东亚鲤也确实比其它鲤科鱼类表现得更活跃、更敏感。因此，研究人员推测这些涉及大脑等神经调控层面的“创新”可能有助于东亚鲤更好地应对季风区水体环境的季节性变化。 

　　4、此外，研究人员还发现东亚鲤成员间存在十分普遍的基因流，这些基因流事件多发生于的古老的演化支系间。因此，研究人员推测这些古老的基因流也可能参与了东亚鲤的辐射。