现代长江的起源及南亚、东亚水系的演变与新近纪青藏高原隆升和现代亚洲季风系统建立息息相关。然而，准确刻画长江水系的时空演变规律一直以来都面临挑战。之前的地质学研究基于不同的采样地点、测年方法和替代指标进行了估算，认为古金沙江在“第一湾”开始改道东流和三峡贯穿的时间从始新世到最近的更新世都有可能。 

　　河流的地貌过程在很大程度上促进了淡水鱼类的多样性演化，反过来，重建淡水鱼类的系统地理动态亦可对河流系统的时空演变进行重演，这正在日益成为一个科学共识。鲤科鱼类东亚特有类群由青藏高原隆升期间强烈的东亚季风影响下演化而来，并适应了这独特的气候和水文条件。在这一特有支系中，一些底栖产卵鱼类产粘性卵或沉性卵，而另一些河流产卵鱼类则产漂流性卵。漂流性卵被认为是东亚鲤科鱼类在季风气候及大河环境中生存的关键特征。 

　　中国科学院水生生物研究所谢平研究员团队联合国内外学者基于化石标定的鲤科鱼类线粒体系统基因组学分析，推断了鲤科鱼类东亚特有类群的多样化动态、祖先分布与祖先卵型，并讨论了古金沙江南流经“第一湾”与中游连通形成长江生态系统（包括中下游江湖复合生态系统）的时间。 

　　研究结果表明，在距今大约2300万年长江水系形成之前，东亚特有鲤科鱼类的祖先分布在东亚南部从古红河到古珠江水系（图1Bb）。此时古金沙江大致沿着现代红河的河道向南流入南海。在距今大约1800万年前，鲤科鱼类东亚特有类群扩散到长江流域并演化出产漂流性卵鱼类，此时在区域地表隆起与大型走滑构造作用和气候变化下现代长江水系已经形成（图1Bc）。长江河流生态系统形成时间大约距今1800至2300万年前，此时季风气候增强。值得注意的是，鲤科鱼类东亚特有类群在距今大约1500万年前再次演化出了产粘性卵鱼类（图1Bd），恰巧与这一类群的净分化速率上升至峰值和强烈的东亚夏季风相耦合（图1C）。这表明长江水系很可能在当时已经发育形成高生产力的江湖复合生态系统。本研究基于鲤科鱼类东亚特有类群的系统发育关系并结合化石定年，约束了长江水系地质和生态演化重大事件的年代，为重建长江水系的地质与生命演变历史提供了新的范式。 

图1 鲤科系统发育关系和鲤科鱼类东亚特有类群多样化历史 

注：（A）基于贝叶斯分析的118种鲤科鱼类和3种鳅科鱼类线粒体基因组的系统发育关系；（B）在青藏高原隆升和长江水系发育下鲤科鱼类东亚特有类群卵型演化和历史分布扩散示意图；（C）鲤科鱼类东亚特有类群多样化动态和宏观演化模式。 

　　该研究以“The evolutions of the Yangtze River and its biodiversity”为题在线发表于The Innovation。水生所陈峰博士、薛阁博士生、王也可博士（现为浙江大学博士后）和云南大学张虎才教授为论文共同第一作者，水生所谢平研究员、陈隽研究员为共同通讯作者。中科院版纳植物园星耀武研究员、美国路易斯安那州立大学Clift教授、路易斯安那大学拉法叶分校Albert教授参与了该研究。该研究得到中国科学院战略性先导科技专项（B类）“大尺度区域生物多样性格局与生命策略”（XDB31000000）项目资助。 

　　论文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666675823000450